有機產品管制上路，農民和學者都有意見；部分農民抱怨，「不是我們不申請，而是困難度太高」；宜蘭大學有機產業發展中心主任黃璋如則認為，農委會對進口有機品認定太寬，源頭沒管好，叫民眾如何吃得健康？
黃璋如和多名學者參與認證審查，通過英、美、德、法、紐、澳等十八個國家的有機認證。她表示，農糧署後來擴大解釋，竟同意這些國家在第三國的認證，也准以有機的名義進口，她們不願背書，已連署書抗議，農糧署還未答覆。
新制上路，農友抱怨更多；彰化縣多處葡萄園標榜生產有機葡萄，全未取得有機認證，吳姓農民無奈地說，花費數百萬元從事有機生產根本收不回成本。
他表示，鄉鎮市農會很多年前推廣有機農業、生產履歷認證，後者較容易做到，前者難度非常高，除非財團投入資金，一般農民很難達成。
首先土壤和水源須潔淨無汙染，但彰化小型工廠林立，早年汙水排入灌排溝渠，土壤多少殘留汙染，吳姓農民有意雇工更換新土，鑿井抽水灌溉，「光這兩項，就得花費二、三百萬元」。
接下來聘請專家學者輔導、評鑑有機農業每個生產過程，搭溫室防蟲、使用無汙染有機肥，「每走一步（過程）都要錢」，一分農地變有機生產農場的成本至少一百萬元。
台東縣池上鄉農民陳文源也抱怨有機認證費用昂貴，過程複雜，「以前以為不噴農藥、化肥就是有機，後來才知道差很多，有機不是我們小農民有辦法處理的，政府應該慢慢輔導農民，而不是只訂期限讓農民手忙腳亂」。
「好像逼我們這些散戶向農會和大米廠靠行，不太公道」，台東關山鎮黃姓農民反問政府：「有機栽種不算是有機嗎？為什麼要這麼麻煩？」
【聯合報╱記者施鴻基、簡慧珍／連線報導】2009.08.01 |
